Le Conseil Pastoral du Jura pastoral (CPaJ) veille à «étudier l’activité pastorale, à l’évaluer et à proposer des conclusions pratiques». Dans l’esprit des Orientations pastorales «Une Eglise rayonnante de l’Evangile», le nouveau CPaJ est appelé à mener des réflexions en phase avec la vie de l’Eglise du Jura pastoral et les besoins actuels des femmes et des hommes de ce temps, disent encore les nouveaux statuts.

Le CPaJ est composé de personnes bénévoles désignées par les Unités pastorales et par les Missions linguistiques. Trois membres sont appelés par le délégué épiscopal, trois agents pastoraux représentant les Services, les paroisses et les communautés religieuses.