L’évêque de Bâle reconnaît une organisation propre pour la partie francophone de son diocèse, appelée aussi Jura pastoral, qui est composée du canton du Jura, du Jura bernois et de Bienne francophone.

Pour cette mission, le vicaire épiscopal est secondé par un-e adjoint-e pour la pastorale et un-e adjoint-e pour le personnel. Le Centre pastoral du Jura, son-sa directeur-trice et le personnel administratif, apportent leurs compétences respectives pour l'accomplissement des tâches du vicaire épiscopal.

Le Jura pastoral appartient à la région diocésaine Sainte-Vérène (Soleure, Berne Jura), l’une des trois régions diocésaines avec la région St-Urs (Bâle-Ville, Bâle-Campagne, Argovie) et la région St-Viktor (Lucerne, Zoug, Schaffhouse, Thurgovie).

L'élaboration des décisions se fait au travers des démarches synodales qui impliquent plusieurs conseils, commissions et coordinations pastorales :

• Conseil du Vicaire Episcopal (CVE)
• Conseil Pastoral du Jura pastoral (CPaJ)
• Commission de la pastorale
• Commission de gestion du personnel
• Coordination pastorale Formation
• Coordination pastorale Jeunesse
• Coordination pastorale Médias
• Coordination pastorale Santé-Social
• Coordination pastorale Spiritualité-Liturgie